În vara lui 2022, FC Botoșani a renunțat la vechiul logo și a adoptat o emblemă cu totul diferită.
În centrul noii identități stă un cal înaripat, asemănător celebrului Pegasus din mitologie, înconjurat de aripi stilizate și încununat de o coroană gotică, inspirată din sigla orașului. Sloganul echipei a fost și el schimbat în latină: „Semper altius!”, adică „Tot mai sus!”.
Noua siglă e gândită să inspire forță, viteză și ambiție. Simbolul mitologic ales, Pegasus, reflectă dorința echipei de a se reinventa, de a depăși limitele și de a se înălța cât mai sus. Mai mult, culorile tradiționale au fost păstrate: roșu, alb și albastru, potrivit sport.ro

După sezoane în care a stat cu emoții în zona retrogradării, FC Botoșani pare că renaște odată cu noua identitate.
În sezonul 2025/26, echipa a început bine: este neînvinsă după 3 meciuri, cu egaluri cu Farul (1-1) și Dinamo (0-0), plus o victorie categorică, 4-0 cu Unirea Slobozia. Cu 5 puncte, ocupă locul 6 în clasament.
Asta după ce, sezonul trecut, clubul a terminat pe locul 6 în play-out, cu doar un punct peste zona retrogradării. Iar în urmă cu două sezoane, a fost chiar pe loc de baraj, salvându-se cu emoții în fața celor de la CS Mioveni.
Dacă vorbim despre sezoanele clubului moldovean, este demnă de menționat stagiunea 2020/21, singura unde formația din Botoșani a terminat sezonul în play-off, pe locul 6.